Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms