Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxb2P0C1T1 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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