Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Hoxd11P23813 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms