Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
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