Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms