Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms