Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crlf3Q9Z2L7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms