Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc23a1Q9Z2J0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms