Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn7Q9Z261 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn7Q9Z261 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms