Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccne2Q9Z238 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccne2Q9Z238 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms