Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfkbiaQ9Z1E3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms