Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms