Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp2Q9Z0Z3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp2Q9Z0Z3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms