Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn3Q9Z0G9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn3Q9Z0G9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms