Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms