Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkraQ9WTX2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkraQ9WTX2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms