Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV7

Rlim, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlimQ9WTV7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RlimQ9WTV7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RlimQ9WTV7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms