Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms