Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms