Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Nek3Q9R0A5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Nek3Q9R0A5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Nek3Q9R0A5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek3Q9R0A5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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