Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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