Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms