Protein–RNA interactions for Protein: Q9R022

Dnajc12, DnaJ homolog subfamily C member 12, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc12Q9R022 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc12Q9R022 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajc12Q9R022 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms