Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms