Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms