Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc4Q9QZD4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms