Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms