Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms