Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Six6Q9QZ28 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
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