Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tomm40Q9QYA2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tomm40Q9QYA2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms