Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms