Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pcsk1nQ9QXV0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms