Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms