Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChmQ9QXG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms