Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms