Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptf1aQ9QX98 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms