Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phc2Q9QWH1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phc2Q9QWH1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms