Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma6Q9QUM9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms