Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cln8Q9QUK3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms