Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms