Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms