Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms