Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms