Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms