Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms