Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms