Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Gde1Q9JL56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Gde1Q9JL56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gde1Q9JL56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gde1Q9JL56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gde1Q9JL56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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