Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms