Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms