Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ldb3Q9JKS4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms